胶质瘤是一种广泛类型的脑肿瘤，起源于神经胶质细胞。低级别胶质瘤（LGG）由世界卫生组织（WHO）II级和III级胶质瘤组成。由于LGG可以渗透到邻近区域，因此难以完全切除肿瘤并且导致复发和恶性进展为高级别胶质瘤。研究人员的研究揭示了LGG中强大的生存指标，可通过免疫组织化学检查以预测较低分级的结果。此外，它揭开了新的治疗目标，以提高LGG患者的生存。
　　 为了基于LGG中的蛋白质表达鉴定预后特征,研究人员分析了来自癌症基因组图谱群组的LGG样品（n=380）的反相蛋白质阵列数据。研究人员将样本随机分层为发现（n=228）和验证数据集（n=152）。研究人员使用具有年龄，WHO等级和IDH突变状态的发现数据集对蛋白质（n=219）进行多变量Cox比例风险回归分析。
　　 研究人员确定了四种蛋白质预后特征，可以将患者分为高风险和低风险。该特征估计两项发现中高危患者的总生存率较低（风险比[HR]=4.11;95％置信区间[CI]=2.18-7.75;p<0.0001）和验证数据集（HR=3.49;95％CI）=1.52-8.01;p<0.0001）。在四种标志物中，发现CHK2_pT68具有保护作用，而MSH6，ARID1A和PAXILLIN与较差的存活率相关。此外，该特征的多变量Cox比例风险回归分析与年龄，WHO等级和IDH突变状态显示该预后特征是两个数据集中的独立预测因子。
　　 研究人员的发现发现了一组潜在的蛋白质生物标志物来预测生存，它将有助于LGG患者的后续治疗管理。
　　 基于组织学特征，神经胶质瘤被世界卫生组织（WHO）分类为I-IV级。低级别胶质瘤（LGG）包括WHOII级弥漫性低级别和III级中级胶质瘤。LGG包括星形细胞瘤，少突胶质细胞瘤和少突细胞瘤。LGG的生存期从1年到15年不等。LGG的组织病理学分类是长期建立的分类，但由于观察者内部和观察者之间的差异，它缺乏对等级的精确预测。世卫组织在2016年修订了弥漫性胶质瘤分类，其中考虑了组织病理学和分子标记。LGG根据IDH突变状态分类。具有IDH突变的LGG显示出比具有IDH野生型的LGG有利的存活结果。IDH突变胶质瘤被归类为弥漫性星形细胞瘤（缺乏1p/19qco-deletion，可能含有TP53突变和ATRX）损失）和少突神经胶质瘤（1p/19qco-deletion）。少数LGGs显示（具有完整1P/19Q突变体突变体IDH1andATRX）和少突星形细胞瘤两者的特征（突变IDH1和野生型与ATRX1p/19qco-deletion）,并且它们作为少突提及。具有1p/19qco-deletion的IDH突变的LGG患者表现出比缺乏1p/19qco-deletion的患者更高的存活率。
　　 修饰的蛋白质组反映了各种途径的最终结果,并为癌症的治疗靶向提供了希望。由于翻译后修饰和其他因素，细胞中蛋白质的量与其相应mRNA表达的绝对丰度无关。因此，肿瘤的蛋白质组学分析提供了来自RNA或DNA测序的独特信息。领先的高通量蛋白质组学技术帮助研究人员量化大量蛋白质和多个样品。反相蛋白质阵列（RPPA）是一种基于抗体的技术，由固相上的多个样品组成。许多临床研究利用RPPA技术研究预后。使用RPPA在卵巢肿瘤中预测复发的时间。此外,部分研究人员显示了该技术的临床应用。在乳腺癌中，它已被广泛用于开发能够成功预测生存的基于蛋白质的预后特征。
　　 在本文中,研究人员分析了来自癌症基因组图谱（TCGA）队列的LGG样品的RPPA数据。研究人员对蛋白质（n=219）进行了多变量Cox比例风险回归分析，其中包括年龄，WHO等级和IDH突变状态等因素。研究人员使用样本分裂方法并将TCGA队列分为发现和验证集。通过对一批基因进行Cox多变量分析，研究人员成功鉴定了四种蛋白质组学标志物CHK2（pT68），MSH6，ARID1A和PAXILLIN，可以准确地将LGG患者分为高风险和低风险。
　　 较低级别的胶质瘤（LGGs）包括弥漫性低级和中级神经胶质瘤。LGG本质上是侵入性的。LGG患者存活1至15年），IDH突变状态是众所周知的LGG预后指标。具有IDH突变的患者比具有野生型IDH1的患者存活得更好。具有IDH突变和1p/19qco-deletion的LGG比具有IDH突变且缺乏1p/19qco-deletion的LGG存活得更好。
　　 在这项研究中，研究人员开发了四种蛋白质预后特征，可以根据生存情况将LGG患者分为高风险和低风险。研究人员在验证数据集中测试了研究人员的发现。多变量Cox比例风险回归分析显示，四蛋白预后特征独立于其他生物标志物，如年龄，WHO等级和IDH突变状态。该研究开发的四蛋白预后特征包括一种保护性蛋白（CHK2pT68）和三种与风险相关的蛋白（MSH6，ARID1A和PAXILLIN）。与低风险患者相比，低风险患者的保护性蛋白质在高风险患者中被上调，高风险患者的风险蛋白质被上调。保护性蛋白质可以作为各种抑制性转换致癌途径，而风险蛋白可能会促进各种恶性特性，如增殖，迁移和入侵。
　　 检查点激酶2（CHK2）是丝氨酸/苏氨酸激酶和DNA损伤反应（DDR）的一部分。CHK2被应激激活并磷酸化各种蛋白质，其执行各种功能，如DNA修复，细胞周期检查点的激活和诱导衰老或凋亡。CHK2蛋白在各种癌症中被证明是肿瘤抑制因子。与先前的报道一致，研究人员发现CHK2（pT68）作为良好的预后指标，因为T68的磷酸化是随后通过自身磷酸化激活CHK2的必要步骤。MutS同源物6（MSH6）蛋白参与DNA错配修复。的MSH2和MSH6形成异二聚体复合物和复合物识别的单碱基插入/缺失或碱基替换的错配。据报道，与未治疗的患者相比，接受替莫唑胺治疗的复发性GBM患者中MSH6上调，并且其在替莫唑胺耐药的GBM细胞中升高。具有较低/无MSH6表达的高级星形细胞瘤患者比具有较高MSH6表达的患者存活得更好。与上述研究一致，研究人员的结果显示,MSH6蛋白表达水平低的患者存活率更高。富含AT的相互作用结构域1A（ARID1A）是染色质重塑SNF/SWI家族的成员，其由DNA结合和C末端组成。保守的域。它在不同的癌症中以上下文依赖的方式充当肿瘤抑制因子或致癌基因。导致ARID1A基因功能丧失的突变可在一些癌症中起到肿瘤抑制因子的作用。相反，研究显示ARID1A的致瘤作用。研究人员的研究表明，ARIAD1A是胶质瘤的不良预后因子，它可能通过诱导细胞色素介导的细胞氧化损伤诱导肿瘤发生。PAXILLIN是细胞质粘着斑的一部分采用者和它参与外部信号转导入细胞内反应。PAXILLIN的过度表达促进胶质瘤细胞的迁移和侵袭，而PAXILLIN的沉默显示胶质瘤细胞的迁移和侵袭减少。PAXILLIN已被证明是各种癌症的预后标志物，包括肺腺癌，肝细胞癌，鼻咽癌，卵巢癌和乳腺癌，已经表明PAXILLINmRNA在GBM中过表达，2017a并且它是GBM中不良的预后标志物，研究人员的预测结果相同。
　　 研究人员在高风险患者中鉴定了致癌途径的富集，如G2M检查点，E2F靶标，上皮至间充质转换，通过NFκB的TNFA信号传导和IL6/JAK/STAT3信号传导。总之，研究人员的工作创造了一种强大而简单的方法来预测LGG患者的预后。据研究人员所知,这是LGG相关临床研究的一项新尝试。由于它由四个标记组成，因此可以用于常规病理检查以规划LGG患者的治疗策略。此外,研究人员的研究显示失调的蛋白质调节决定了该疾病的临床结果，并且这些目标可以考虑用于将来可能的治疗干预。