科学家发现间变性少突胶质细胞瘤的新突变基因
间变性少突胶质细胞瘤(AO)是一种罕见的继发性脑肿瘤,治愈后基因差异很大。过去发现大部分AO患者存在性染色体1p/19q缺失和IDH基因变异,认为PCV化疗方案对恶性肿瘤是合理且良好的。随着转录组测序技术的快速发展,在AO中发现了CIC、FUBP1和TERT启动子的突变。最近,英国癌症研究所的KarimLabreche等人进行了AO的全外显子组和转录组测序,探索发现了TCF12基因变异,结果发表在2015年6月的《自然免疫》杂志上。
根据IDH和1p/19q将51例AO患者分为3组:IDH野生型、IDH突变伴1p/19q共缺陷型和IDH突变不伴1p/19q共缺陷型。每组患者的恶性肿瘤标本和血液标本共发现突变4733例,平均每例AO突变37例,细胞突变率为1.62/百万碱基。大部分都是C→T变换。
16例AO患者FUBP1突变,11例CIC突变,37例TERT启动子突变,与以往报道相似。10%的科研人员病历(5/51)发现TCF12突变,TCF12是基本螺旋环螺旋(bHLH)的转录因子12,已在颅缝早期闭合的参考文献中报道。在TCGA生物信息学数据库查询的43例AO病例中,发现2例TCF12突变。作者对另外83例AO病例的转录本进行了测序,发现5例TCF12有突变。因此,本次科学研究134例AO(51+83)中TCF12突变率为7.5%,而WHOⅱⅱ级少突胶质细胞瘤仅有一例突变。
对TCF12突变对肿瘤干细胞危害的进一步科学研究表明,TCF12基因变异可导致TCF12基因表达降低或TCF12与DNA融合率降低。在TCF12中下游,整体靶基因特异性下降(如E钙粘蛋白),而免疫反应通道明显聚集。非特异性TCF12不仅在细胞质中表达,在细胞核中也有表达。TCF12突变型恶性肿瘤具有明显的护栏萎缩和有丝分裂特征,比野生型更具侵袭性。TCF12突变或TCF杂合性缺失倾向于缩短生存期,但本科研的生存分析没有统计学分析的实际意义。
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- 更新时间:2021-01-27 11:57:15